Organisation

Matrice Extra-cellulaire et Dynamique Cellulaire (MEDyC) - UMR CNRS 7369

LAURENT DUCA

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Coordonnées

Secrétariat : Jean-Marc FEREZ (jean-marc.ferez@univ-reims.fr)

Accéder à notre site : www.univ-reims.fr/medyc

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Présentation

Le projet scientifique de l’Unité est totalement centré sur une approche post-génomique des interactions entre cellules et matrice extracellulaire, appliquée au décryptage des mécanismes qui contribuent, d’une part, à la modulation de la progression tumorale et, d’autre part, aux phénomènes de vieillissement de la matrice extracellulaire, une « niche » pour le développement de maladies dégénératives, en particulier dans la paroi artérielle.

Dans le développement de ces études, nous privilégions les approches transversales à l’interface Physique-Biologie-Bioinformatique en associant, pour la résolution des questions posées, les méthodologies biologiques (biochimie, biologie moléculaire, biologie cellulaire, …), biophotoniques (microscopie confocale, imagerie 3D et 4D, les spectroscopies et la modélisation moléculaire (modélisation par homologie, dynamique moléculaire, arrimage moléculaire et étude des interactions molécules/molécules). L’adossement à différentes plateformes technologiques de haut niveau (supercalculateur Romeo (PIA 1 equip@meso GENCI), plateau de modélisation moléculaire multiéchelle (PIA 1 RENABI-IFB), plateau d’imagerie du petit animal (PPF), plateau d’imagerie cellulaire et tissulaire (label IBISA) dont nous avons été les initiateurs s’avère un atout important pour les approches que nous développons. Nous identifions de nouvelles cibles pharmacologiques et de nouvelles molécules à forte potentialité d’applications thérapeutiques (matrikines anti-tumorales, molécules anti-vieillissement tissulaire), visant une pharmacologie ciblée sur la matrice extracellulaire, et de développer de nouveaux outils pour le diagnostic et le pronostic.

Effectif

52 personnels permanents ainsi que 20 doctorants et post-doctorants

Mots clés

matrice extracellulaire, vieillissement, cancer, pathologies vasculaires, modélisation moléculaire, imagerie multiéchelle.

Thématiques de recherche

- Matrice extracellulaire, cancer et cibles thérapeutiques
- Vieillissement matriciel et remodelage vasculaire
- Modélisation et imagerie multiéchelle

Savoir faire

Etude des interactions cellule-matrice extracellulaire en conditions physiologiques et pathologiques in silico, in vitro et in vivo.

- Cultures cellulaires
- Biologie moléculaire
-Toutes analyses de biochimie
- Modélisation moléculaire
- Micro-analyse quantitative non destructive sur systèmes biologiques, cellulaires, matériaux inorganiques et biomatériaux
- Conformations de biomolécules (polymères, acides nucléiques, protéines)
- Caractérisation d’interactions moléculaires
- Physico-chimie à l’échelle de la cellule vivante isolée
- Ingénierie instrumentale et cellulaire
- Imagerie fonctionnelle et moléculaire du vivant (cellulaire, tissulaire, intra-vitale)
- Développements informatiques (traitements de données, traitement d’images, analyse discriminante)

Equipements

Tout matériel de base d’un laboratoire de Biochimie et Biologie Moléculaire (centrifugeuses, ultracentrifugeuses, appareillages pour électrophorèses, appareils de PCR, système de purification de protéines, chromatographe HPLC, congélateurs -80°C, containers à azote liquide)

Laboratoires de cultures cellulaires (L2)

Plates-formes de l’URCA :

- Animaleries conventionnelle et transgénique

- Plateau technique de cytométrie de flux (URCACyt) : analyseur BD FACS Calibur, analyseur BD LSR Fortessa, analyseur trieur BD FACS Aria Ilu.

- Plate-forme d’Imagerie Cellulaire et Tissulaire (PICT), labellisée IBISA : microscope électronique analytique, microscope confocal biphoton Zeiss, microimager RMN Brucker, Vidéomicroscope inversé Axiovert 200 M Zeiss en imagerie multidimensionnelle, Raman axial intravital ; Imageur Raman laser cellulaire et tissulaire ; Spectromètre d’analyse X EDAX pour MEB, microspectromètre Raman laser, Imageur IR Spectrum Spotlight, etc….

- Plate-forme PlAnet (analyse des biomolécules) : microscope à force atomique sous atmosphère contrôlée, spectromètre de masse Q-TOF avec source électrospray, spectromètre MALDI-TOF, spectromètre GC-TOF, chromatographe de partage centrifuge, RMN 500 MHz, etc…

- Plate-forme de modélisation moléculaire multi-échelle (P3M) : salle de modélisation équipée de machines récentes avec écrans 3D, tableaux interactifs et équipements vidéo associés ; Réseau interne spécifique à haut débit, connecté directement au Centre de calcul ROMEO (puissance : 6 TFlops ; 500 processeurs Intel Westmere, 4 cartes GPO fermi, 2 noeuds de visualisation distante)

- Plateau technique d’imagerie du petit animal : Tomographie rayons X, Tomographie de fluorescence, echo-doppler, IRM 3 T

Brevets

- Cyclopeptide à activité anti-cancéreuse.
- Anticorps polyclonal dirigé contre la protéine EBP.
- Synthèse d'analogues C-glycosidiques d'x-galactosyl-céramides.
- Conception d'un peptide antagoniste de la liaison CD47-thrombospondine
- Méthode pour produire des mélanges d’oligosaccharides extraits du lin
- Oligosaccharides de haut poids moléculaire pour la réparation et la prévention du vieillissement cutané.

Partenariats

Entreprises privées :

- BASF Beauty Care Solutions France
- COGNIS, BOIRON
- PHARMASEED LTD
- Acanthe Biotech
- Bull SAS
- Soliance-Givaudan …

Académiques :

De nombreuses collaborations scientifiques sont en cours avec des partenaires académiques au niveau national et international.

- CNRS
- INSERM
- INRA
- Cancéropole Grand Est

Autres

- SATT Nord

Organigramme du laboratoire

Date de mise à jour : janvier 2018

Organigramme

Equipe

STEPHANE BREZILLON

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