L’axe transversal, en lien direct avec les axes I et II du projet vise à répondre aux objectifs suivants :

• Optimiser l’identification des métazoaires et protozoaires étudiés par une approche intégrative combinant une expertise en parasitologie, entomologie, mycologie, biologie moléculaire, spectroscopie, pour permettre la création de bases de données biologiques et moléculaires de référence, pour la reconnaissance et l'identification de ces agents rares et mal connus ;
• Développer des outils pour évaluer la circulation des agents pathogènes dans des conditions naturelles afin d'améliorer la gestion des risques, les conséquences économiques et les questions environnementales liées à ces agents pathogènes ;

Les méthodologies et approches développées pourront également être utilisées pour l’étude, l’identification ou la reconnaissance d’autres agents pathogènes (e.g. mycologie médicale).